然后离开了。我们签署了合作协议。我可以劳动仲裁他吗？？

可以劳动仲裁。依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，您与公司存在劳动关系且签署合作协议，公司未支付工资违反劳动法，可申请仲裁维护权益。不及时处理可能导致您的合法权益长期受损，影响个人经济和生活。
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常见处理方式为劳动仲裁或诉讼。建议先尝试与公司协商，若协商无果则向劳动争议仲裁机关申请仲裁，对仲裁结果不满可再提起诉讼。选择时需考虑效率与成本，仲裁通常更快且成本较低。
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可劳动仲裁。操作如下：1.收集证据，如合作协议、工作记录等；2.向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据；3.等待仲裁委受理并安排开庭；4.如对仲裁结果不满，可向法院提起诉讼。